阴茎大小和功能之间的关系并不密切。通常情况下，阴茎大小主要与正常生理功能并无关联。当阴茎短小时，可能会与疾病有关，如原发性睾丸功能减退症、隐睾症、性激素分泌不足以及发育不良等。针对这些疾病，需要明确病因，并采取相应的治疗措施。

1. 原发性睾丸功能减退症：这是一种内分泌失调性疾病，主要表现为睾丸内分泌功能降低，导致雄激素水平下降，从而影响男性第二性征的发育。如果阴茎短小，患者可以遵医嘱使用他莫昔芬进行治疗。

2. 隐睾症：隐睾症是由于睾丸无法正常降落到阴囊内，而是停留在腹腔内。由于隐睾位于阴囊内，可能会导致阴茎短小。手术是治疗隐睾症的主要方法之一，可以将隐睾取出。

3. 性激素分泌不足：性激素包括雌激素和雄激素，它们对人体的生殖和发育至关重要。当人体缺乏雌激素、雄激素时，可能导致阴茎较短小。患者可以通过口服补充雌激素、雄激素的药物治疗，如十一酸睾酮软胶囊。

4. 发育不良：发育不良是一种先天性阴茎发育不良的疾病，较为罕见。患者可以通过后天手术治疗，如阴茎延长术。此外，中医治疗也可以改善阴茎大小，如中医中药治疗。中医认为肾是先天之本，肾功能强大，阴茎也会较快发育。

在临床上，通常会选择补肾的药物来治疗阴茎大小问题，如六味地黄丸、右归胶囊等。中医认为肾是先天之本，肾功能强大，阴茎也会较快发育。